실질주주 확인, 차명주식·우회지배 리스크 줄이는 실무 가이드

#기업 세무조사 대응 #명의신탁주식 #실질주주 #실질주주 확인 #지배구조 투명성 #차명주식 리스크 #확인

실질주주 확인’은 형식상 명의(등기부·주주명부상의 주주)가 아닌, 실제로 회사 지분을 지배·통제·이익을 향유하는 사람(실질소유자·Beneficial Owner)을 찾아내는 과정입니다.
이 글을 통해서 당신한테 실질주주 확인의 기본 개념, 법적·세무 리스크, 실무상 확인 방법, 조사·수사 대응 팁, 자주 묻는 질문을 알려주겠습니다.

‘실질주주 확인’ 개요

1. 실질주주(실질소유자)란 무엇인가

  • 형식상 주주(명의주주)
  • 실질주주(실질소유자)
    • 다음과 같은 요소를 종합해 볼 때, 실제 주식의 경제적 이익과 의결권을 지배하는 사람
      • 투자자금 실제 출처
      • 배당·양도대금 귀속처
      • 의결권 행사 지시 여부
      • 회사 주요 의사결정 관여 정도
  • 실무에서 자주 등장하는 표현
    • 실질주주, 실질소유자, Beneficial Owner, UBO(Ultimate Beneficial Owner), 차명주주 관계

왜 ‘실질주주 확인’이 중요한가

1. 기업이 실질주주를 확인해야 하는 대표적인 이유

실질주주 확인이 문제되는 대표 상황

1. 차명주식·명의신탁주식 관련

  • 대표·오너가 다음과 같이 주식을 보유한 경우
    • 가족·친척·임직원·지인의 이름으로 주식을 보유
    • 세금·채권자 회피를 목적으로 타인 명의로 주식 분산
    • 상장 준비 전에 지분 집중이 부담되어 형식상 지분 분산
  • 이때 국세청·수사기관은 다음을 집중적으로 봅니다.
    • 실제 투자자금이 누구 돈인지
    • 배당·양도대금이 실제로 누구에게 귀속되었는지
    • 회사 의사결정에서 누가 실질적으로 영향력을 행사했는지

2. 비상장사 지분 구조가 복잡한 경우

3. 상장·IPO, 대규모 투자 유치 과정

  • 거래소·금융당국·주관사·VC가 실질주주 구조를 강하게 요구
  • 확인 포인트
    • 최대주주·특수관계인의 실질 지분율
    • 우회지배·차명주식 존재 여부
    • 과거 지분 이동 내역과 자금 출처

실질주주 vs 명의주주: 무엇이 다른가

구분 명의주주(형식상 주주) 실질주주(실질소유자)
기준 주주명부·등기부·계약서 등 형식상 명의 자금 출처, 이익 귀속, 의결권 통제 등 실질 관계
법적 지위(상법) 원칙적으로 주주로 추정 분쟁 시 ‘진짜 소유자’로 인정될 수 있음
세법상 과세 명의가 아니라 실질 귀속자 기준 과세 실질과세 원칙에 따라 과세 대상
형사책임 형식상 주주가 아니라도 실질 지배자 처벌 가능 배임·횡령·조세포탈·시세조종 등에서 주 타깃
분쟁 발생 시 명의자와 실질소유자 사이 소유권 분쟁 빈번 입증에 실패하면 권리 주장 어려움
실질주주 확인의 법적 근거·관점

1. 세법(실질과세 원칙)

  • 국세기본법의 실질과세 원칙
    • 거래의 형식이 아닌 실질 내용에 따라 과세
    • 주식의 명의가 누구냐보다, 실제로 이익을 누린 사람이 누구인지가 중요

2. 상법·자본시장법 관점

  • 상법
    • 주주명부상 주주가 주주로 추정되지만,

명의신탁, 위장거래가 입증되면 실질주주가 문제의 중심이 됨

실질 지배자·실질주주가 누구인지책임 판단의 핵심

3. 자금세탁방지(AML)·금융 관련 규제

  • 금융회사, 가상자산사업자 등
    • 고객의 실질소유자 확인 의무(KYC, AML)
    • 법인 고객의 경우, 최종 지배자(UBO) 식별 요구
  • 실무상 요구되는 정보
    • 25% 이상 지분 보유자
    • 지분이 적더라도 사실상 지배력을 행사하는 자

실질주주 확인, 어떻게 진행해야 하나 (실무 체크리스트)

1. 내부적으로 먼저 점검해야 할 자료

  • 회사 내부 문서
  • 자금 흐름 관련 자료
    • 주식 인수 자금의 실제 입금 계좌
    • 배당금·양도대금 수령 계좌
    • 대표·임원 개인 계좌 거래 내역(필요시)
  • 실제 의사결정 구조
    • 이사회·주총에서 누가 발언·지시하는지
    • 공식 직함이 없는 오너·가족의 영향력 여부

2. 외부에서 확보 가능한 정보

  • 등기부등본(법인, 개인)
  • 금융기관 거래내역(금융정보 제공 동의 필요)
  • 국세청·관세청 등 공공기관 자료(조사·수사 단계)
  • 공시자료(상장사·대규모 비상장사)

3. 실질주주 추정에 사용되는 주요 지표

  • 자금 측면
    • 주식 인수 자금이 실제로 어느 계좌에서 나갔는지
    • 대출을 활용했다면, 누가 대출 상환을 부담했는지
  • 이익 귀속 측면
    • 배당금·매각대금이 최종적으로 어디로 이동했는지
    • 관련 자금이 대표·오너 개인 계좌로 회귀하는 구조인지
  • 지배력 측면
    • 회사 인사·투자·배당·계열사 구조 등에 누가 최종 결정권을 행사하는지
    • 명의주주가 스스로 의결권을 행사하는지,
    • 아니면 지시에 따라 형식적으로 행사하는지

실질주주 확인이 필요한 대표 사례 유형

1. 오너 일가 차명주식

  • 상황
    • 오너가 가족·임직원 명의로 주식을 분산 보유
    • 세무조사에서 자금 출처가 모두 오너 개인 계좌로 드러남
  • 리스크
    • 명의신탁 증여의제에 따른 증여세 부과
    • 차명주식 활용 비자금 조성 시 횡령·배임·조세포탈 혐의

2. 임직원 명의로 된 지분 인센티브

  • 상황
    • 스톡옵션 대신 명의만 직원에게 주고, 이익은 회사/오너가 가져가는 구조
    • 퇴사 시 주식 명의만 다시 회수
  • 리스크
    • 실질주주가 오너로 판단될 경우
      • 직원은 명의만 빌려준 ‘차명주주’
      • 세법상·형사상 책임 분배 문제 발생

3. 해외 SPC·페이퍼컴퍼니를 통한 우회투자

  • 상황
    • 조세회피지역에 설립한 SPC를 통해 국내 회사에 투자
    • 실제 자금은 국내 오너 개인 계좌에서 출발
  • 리스크
    • 국외재산 신고의무, 해외법인 관련 세법 위반
    • 실질적으로 국내 오너가 지배하는 구조로 인정될 수 있음

실질주주 확인 과정에서 기업이 유의해야 할 점

1. 임의로 자료를 삭제·변조하지 말 것

  • 세무조사·수사 가능성이 있을 때
  • 권장되는 태도
    • 사실관계를 내부적으로 정확히 정리
    • 외부 전문가와 상의하여 설명 논리·자료 정비

2. 섣부른 진술·문서 제출 자제

  • 조사기관·세무당국에
    • 감정적으로 대응하거나,

전체 구조를 고려하지 않고 부분적인 진술을 하면

    • 나중에 스스로 발목을 잡을 수 있음
  • 실무 팁
    • 질문 요지·범위를 정확히 파악
    • 필요시 진술서·의견서 형태로 정리된 입장 제출

3. 과거 차명 구조를 ‘합법화’하려는 시도 주의

  • 명의신탁 해소 과정에서
    • 명의신탁 사실을 인정하는 계약서·각서를 섣불리 작성하면
    • 오히려 과거 위법 사실을 자인하는 증거가 될 수 있음
  • 구조 정리 시
    • 세무·형사 리스크를 함께 검토한 뒤,

세무상·법률상 안전한 절차로 정리하는 것이 중요

실질주주 확인을 위한 단계별 실무 가이드

1단계: 회사 내부 진단

  • 다음 질문에 스스로 체크해 보는 것이 좋습니다.
    • 주주명부상 주주와, 실제 회사 의사결정권자가 일치하는가
    • 누가 돈을 냈고, 누가 이익을 가져가는가
    • 가족·임직원 명의 주식이 있다면, 당시 자금 출처를 설명할 수 있는가
  • 내부 진단 시 활용 자료

2단계: 리스크 유형별 분류

3단계: 구조 정리·대응 전략 수립

  • 가능하면 다음 방향을 목표로 합니다.
    • 차명·우회 구조를 단계적으로 해소
    • 지분·계약관계를 단순하고 투명한 구조로 정리
    • 향후 투자·IPO·M&A를 고려한 중장기 설계

자주 묻는 질문(FAQ)

Q1. 명의만 빌려준 직원·가족도 처벌을 받나요?

  • 상황에 따라 다르지만, 다음 요소가 중요합니다.
    • 단순히 명의만 빌려준 것인지
    • 자금 출처·이익 귀속에 대해 인식·관여 정도
    • 차명 구조가 조세포탈·비자금 조성에 이용되었는지 여부
  • 단순 명의대여자라도 조세포탈 공범·범칙행위 가담자로 평가될 수 있어
    • 사전에 구조를 정확히 파악하는 것이 필요합니다.

Q2. 과거에 만든 차명주식을 지금 정리하면 문제가 줄어드나요?

  • 무조건 “정리하면 괜찮다”는 것은 아닙니다.
    • 정리 과정에서 명의신탁 사실을 명확히 드러내는 증거가 생길 수 있음
    • 증여세·양도소득세·가산세추가 세 부담이 발생할 수 있음
  • 따라서
    • 세무·법률 리스크를 함께 분석한 뒤
    • 가장 부담이 적은 정리 방법·시점을 선택하는 것이 중요합니다.

Q3. 실질주주가 누구인지 애매한 경우, 세무조사에서 어떻게 보나요?

  • 국세청은 다음과 같은 요소를 종합적으로 봅니다.
    • 투자자금 출처(누가 돈을 냈는지)
    • 배당·양도대금의 실제 귀속
    • 회사 의사결정에 누가 영향력을 행사했는지
  • 여러 정황을 종합해 일관된 설명과 증빙이 있으면

납세자에게 유리하게 평가될 여지도 있으나,

    • 자료와 설명이 엇갈리면 과세·가산세 리스크가 커집니다.

Q4. 실질주주 확인을 위해 회사가 직원 개인 계좌까지 봐야 하나요?

  • 내부 진단 차원에서
    • 직원·가족 명의의 계좌를 확인할 필요가 생길 수 있으나,
    • 이는 개인정보·사생활 침해 문제와도 연결됩니다.
  • 실무적으로는
    • 당사자 동의 하에 필요한 범위 내에서 확인
    • 세무조사·수사 단계에서는 기관을 통한 공식 자료 확보가 일반적입니다.

Q5. 스타트업·초기 기업도 실질주주 확인이 필요한가요?

  • 특히 필요합니다.
    • 초기 투자·지분 설계가 향후 투자·상장 시 그대로 검증되기 때문입니다.
  • 초기 단계에서
    • 차명주식·우회지분 구조를 만들지 않는 것
    • 지분·계약을 단순하고 투명하게 관리하는 것이
    • 나중에 큰 비용과 리스크를 줄여줍니다.

마무리: 실질주주 확인은 ‘지금’ 점검하는 것이 비용을 줄입니다

  • 실질주주 확인은
    • 세무조사·수사 단계에서 처음 대응하면 이미 늦은 경우가 많습니다.
  • 기업 대표·임직원 입장에서
    • 지금 회사 지분 구조와 자금 흐름을 점검하고
    • 문제 소지가 있는 차명·우회 구조를 파악해 두는 것만으로도
    • 향후 리스크를 크게 줄일 수 있습니다.
  • 특히
    • 상장·대규모 투자·M&A를 계획하고 있다면
    • 실질주주 구조를 투명하게 만드는 작업은 선행 과제에 가깝습니다.
본 게시물은 일반적인 법률 정보를 안내하기 위한 것이며, 실제 법률 상담을 대체하지 않습니다. 여기에서 설명되는 내용은 통상적으로 알려진 법률 정보를 정리한 것으로, 개별 사건의 특성에 따라 달리 해석될 수 있습니다. 또한 법령, 시행령, 판례 등은 시간이 지나면서 변경될 수 있어 본 게시물의 일부 내용이 최신 법률과 다를 가능성도 있습니다. 구체적인 사건에 대한 법적 판단은 사실관계와 증빙자료에 따라 크게 달라질 수 있으므로, 반드시 관련 자료를 지참하시어 전문 변호사와 직접 상담하시기 바랍니다. 본 게시물의 내용을 기반으로 한 모든 행동 또는 결과에 대해 작성자는 법적 책임을 지지 않음을 알려드립니다.